2001年
5月
深圳市政府与哈工大签订市校合作办学协议，合作创办“哈尔滨工业大学深圳研究生院”。

2002年
2月
教育部批准设立“哈尔滨工业大学深圳研究生院”，和清华大学深圳研究生院、北京大学深圳研究生院一起进驻深圳大学城。

2003年
12月
首届研究生毕业，论文被哈工大学位评定委员会评定为高质量论文。

2009年
12月
市校签署合作备忘录，首次提出开展本科教育。

2012年
5月
建院十周年，时任中共中央政治局常委、校友李长春来院视察。

6月
办学十周年，建成了约3000名师生的办学规模，在科学研究、人才培养、队伍建设、体制创新、社会服务等方面取得长足进步，对于推动哈工大自身发展、促进产学研相结合具有重要的意义，同时也对深圳经济社会发展作出了积极贡献。

6月
2000余名师生、校友、嘉宾齐聚一堂，共同庆贺建院十周年。
2014年
4月
市校签署办学协议，共建哈工大（深圳）。

5月
教育部批准哈工大深圳研究生院筹备举办本科教育。深圳市政府与哈工大签署新的合作办学协议，在与哈工大本部统一品牌、统一规划、统一学术标准的前提下，在深圳研究生院基础上筹备共建本硕博教育体系完备的“哈尔滨工业大学（深圳）”。
同日，哈工大与深圳市政府、中国航天员科研训练中心签署三方合作协议，依托深圳研究生院共建“深圳国际太空科技学院”。
5月
太空探索者协会主席道瑞恩和中国载人航天工程办公室副主任杨利伟到校区参观。

2015年
5月
哈工大校领导拜会时任广东省委副书记、深圳市委书记马兴瑞，合力推进哈工大（深圳）建设。

7月
哈工大与深圳市政府、苏黎世艺术大学、加泰罗尼亚高等建筑研究院签署四方合作协议，依托深圳研究生院共建“哈尔滨工业大学（深圳）国际设计学院”。

7月
市校签署协议，共建哈工大（深圳）国际设计学院。
9月
哈工大（深圳）筹建办公室及临时党委相继设立，哈工大（深圳）筹建工作全面、快速推进。
9月
哈工大（深圳）筹建办及临时党委成立会议召开。

9月
哈工大（深圳）筹建办与哈工大校领导共商校区发展大计。

2016年
哈工大（深圳）首次面向全国12个省市招收机械类、材料类、计算机类、电子信息类、土木类、经济学类本科生共376名。就录取分数线来看，在11个省份的录取提档线超过一本线80分，8个省份的录取提档线超过一本线100分。

9月
哈工大（深圳）在深圳音乐厅隆重举行迎新音乐会，欢迎首届本科生入学，奏响校区办学新乐章。

2017年
6月20日
哈工大（深圳）空间科学与应用技术研究院成立，20余位中国科学院和中国工程院院士受聘为特聘教授。

7月
教育部批准哈工大（深圳）正式举办本科教育。
7月17日
哈工大党委书记王树权、校长周玉会见广东省委常委、深圳市委书记王伟中，感谢深圳市委、市政府长期以来的支持，探讨市校双方今后深化合作、促进共同发展的途径。
同日，王树权书记、周玉校长来深圳校区指导工作，寄望全体师生加快推进高水平校区建设。

9月19日
哈工大（深圳）与哈佛大学肯尼迪政府学院达成合作意向，将在项目合作、人才交流、政策研究等方面开展合作。
10月26日
“哈尔滨工业大学（深圳）”经深圳市机构编制委员会批准正式成立。
12月27日
“中共哈尔滨工业大学（深圳）委员会”经中共深圳市委组织部批准正式成立。
2018年
1月15日
深圳市委、哈工大党委公布哈工大（深圳）主要领导任职。哈工大校长周玉兼任哈工大（深圳）校长，深圳市盐田区原区委副书记、区长吴德林任哈工大（深圳）党委书记，哈工大校长助理甄良任哈工大（深圳）常务副校长。

3月
以哈工大（深圳）为主要依托单位、首批广东省实验室之一的鹏城实验室（深圳网络空间科学与技术广东省实验室）启动建设，目前设有网络通信、先进计算和网络安全三个学术方向，致力于成为具有国际领先水平的创新型实验室。

7月
哈工大（深圳）面向全国18个省（市、自治区）首次以单独招生代码（18213）招收优秀本科生760名，其中在广东省招生人数为157人，理科投档线居省内高校之首。除浙江为高考综合改革试点、江苏高考总分为480分外，哈工大（深圳）在其他16省的录取提档线均超重点线100分以上，15个省份超重点线110分、12个省份超重点线120分、5个省份超重点线150分。
8月
历经三年建设的新校区交付使用，为哈工大（深圳）的快速发展提供了坚强的保障。新校区建设用地面积9.32万平方米，总建筑面积29.85万平方米，包括教学办公区、实验实训区、学生生活区、综合研发区四个区域共11栋单体，新校区建设工程获得了中国BIM最高级别“荣誉白金级”认证。